ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами.

ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами.

Мир легкомысленно отнесся к предыдущим коронавирусным эпидемиям — на сей раз, хочется надеяться, будет иначе, в том числе и в России: быстрое распространение новой инфекции должно к этому стимулировать.

Эта зима принесла нам тревожные известия о возникновении в Китае и начале активного распространения по всему миру нового коронавируса SARS-CoV-2, вызывающего болезнь под международным названием КоВиД-19 (CoViD-19 — CoronaVirus Disease-19, как ее политкорректно назвали во Всемирной организации здравоохранения). К 10 марта им достоверно, с лабораторным подтверждением, во всем мире заразилось более 110 тыс. человек. Причем сейчас он намного быстрее распространяется вне Китая, чем в самом Китае.

Каковы особенности возбудителя и чем он отличается от других вирусов ОРВИ

Острые респираторные вирусные инфекции (ОРВИ) вызывают более 80% всех острых респираторных заболеваний. Вирусы — это не бактерии, и антибиотики от них не помогают.

Наиболее часто ОРВИ вызываются риновирусами (более 50 разновидностей), вирусами гриппа (минимум четыре подтипа), вирусами парагриппа (четыре разновидности), метапневмовирусами, бокавирусами, респираторно-синцитиальными вирусами, аденовирусами и некоторыми другими.

Обычные четыре разновидности коронавирусов тоже есть этом списке (229E, OC43, NL43, HKU1) и в зависимости от года занимают второе-пятое места по своей доле в общей заболеваемости. Респираторное заболевание они обычно вызывают слабой и средней тяжести, но иногда случаются и тяжелые случаи.

Как большинство вирусных возбудителей ОРВИ, коронавирусы являются РНК-вирусами, но имеют самый большой из них по размеру геном — около 29 тыс. нуклеотидов. Они содержат липидную оболочку, поэтому легко поддаются разрушению мылом и другими ПАВ.

Коронавирусы выявлены практически у всех животных и птиц, но далеко не у всех они вызывают серьезные заболевания.

Разработаны живые противокоронавирусные вакцины для собак и домашних кур, потому что у них соответствующие разновидности вызывают тяжелую хроническую инфекцию и большую вирусную смертность.

Уже имеющиеся и циркулирующие среди людей четыре разновидности коронавирусов, по всей видимости, произошли от коронавирусов животных, поскольку имеют с этими вирусами высокую схожесть геномов.

Но это произошло давно, и на них особого внимания ученые не обращали, просто недооценивая их на фоне вспышек и эпидемий, вызванных вирусами гриппа.

Однако за последние два десятилетия мы стали свидетелями «перескока» на людей уже трех новых разновидностей коронавирусов, и все они имеют предшественников в виде коронавирусов разных видов летучих мышей.

Отметим, что за последнее десятилетие учеными-вирусологами получена масса новых данных о вирусах самых разных животных.

И теперь мы знаем, что летучие мыши, по всей видимости, стали для человечества и для животного мира в целом источниками нескольких весьма значимых вирусных заболеваний: это вирусы кори, другие парамиксовирусы, вирус бешенства, коронавирусы, — и этот список растет.

Как правило, напрямую на человека эти вирусы от летучих мышей не перескакивают, потому что слишком разные у нас и у них клеточные рецепторы. Как показали результаты исследований последних лет, от летучих мышей к человеку вирусы, как правило, проходят через промежуточного хозяина.

ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами.

В 2002–2003 годах ТОРС-коронавирус (SARS), вызвавший эпидемию атипичной пневмонии, по всей видимости, перескочил от летучей мыши на человека, пройдя эволюционно-мутационный процесс в организмах пальмовых циветт (зверьков из подотряда кошкообразных).

В 2007–2012 годах БВРС-коронавирус (MERS) аналогично перескочил от египетских летучих мышей сначала на верблюдов, а потом на людей. Ну а в этот раз новый коронавирус, явно имеющий происхождение от летучих мышей, уже вызвал колоссальную эпидемию практически во всем мире.

Здесь пока что промежуточный хозяин не выявлен, но подозрения падают на панголинов, кошек, бродячих собак, хотя возможны и другие варианты.

Удивляет тот факт, что до сих пор самые близкие по геномным последовательностям к человеческим варианты нынешнего коронавируса — это варианты вирусов от летучих мышей.

Хотя, может быть, это и не должно быть удивительным, на диких рынках в Китае сырые и жареные тушки летучих мышей спокойно продавались годами до этой эпидемии.

В то же время в последние дни появились публикации в ряде научных журналов о том, что сейчас циркулирует сразу несколько разновидностей коронавируса и поэтому, возможно, было несколько «перескоков» коронавируса на человека разными путями.

ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами.

Симптоматика нынешней коронавирусной инфекции: отличия от гриппозной и других

Сейчас можно с полной уверенностью сказать, что только по симптомам никакой врач эту инфекцию от других серьезных вирусных инфекций не отличит. Потому что и лихорадка, и высокая температура, и затрудненное дыхание, и слабость, и боли в мышцах, и сухой кашель характерны и для инфекций, вызванных гриппом и респираторно-синцитиальным вирусом.

Вроде бы единственный признак, который, как правило (но не как закон), не характерен для коронавирусной инфекции, — это заложенный нос. Но и для гриппозной инфекции такое тоже может быть.

Так что для точной постановки диагноза необходима лабораторная диагностика методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) нуклеиновых кислот, выделенных из проб от человека (смывы из носоглотки, мазки из носоглотки и т. д.).

В самом рутинном варианте это занимает четыре-шесть часов (без учета времени на доставку пробы в лабораторию). Коммерческими компаниями, в том числе и в России, разработано несколько экспресс-вариантов диагностикумов, требующих в три-четыре раза меньше времени.

Насколько известно автору, в Китае и США федеральные власти уже приняли решение простимулировать коммерческих разработчиков для быстрейшей сертификации и запуска производств этих тест-систем.

Они будут доступны любому гражданину, а не только людям с ярко выраженными симптомами ОРВИ, а это позволит усилить и ускорить борьбу с эпидемией.

ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами.

Чего ждать и что делать нам

Человечество в настоящее время имеет несколько способов и подходов к борьбе с инфекциями: противоэпидемические мероприятия с как можно более чувствительными и специфичными диагностическими методами, быстрая разработка и применение вакцин. Ну и, конечно же, нужны эффективные методы изоляции и лечения больных.

Зоонозные инфекции и в дальнейшем будут перескакивать с животных на людей, как это и было в течение всей истории человечества.

Примеры: вирус ВИЧ, перескочивший на человека от обезьян; вирус гепатита С, который к людям попал от лошадей или от других животных; вирусы кори и паротита, явно перешедшие на людей от копытных животных или тех же летучих мышей; вирусы клещевого энцефалита, Зика, лихорадок денге и Западного Нила и т. д.

А различные виды коронавирусов за последние 20 лет, как уже сказано, трижды перескакивали на человека от летучих мышей (коронавирусы атипичной пневмонии SARS-CoV-1, ближневосточного респираторного синдрома (БВРС) и нынешний SARS-CoV-2).

Возможны, а вернее всего неизбежны, и другие аналогичные перескоки в будущем. Готовиться к ним надо гораздо более интенсивно, изучая инфекции животных и разрабатывая новые вакцины.

Посмотрите, какая складывается ситуация: после атипичной пневмонии 2002–2003 годов никто так и не разработал вакцины против тогдашнего ТОРС-коронавируса. После открытия коронавируса БВРС в 2012 году тоже не разработали соответствующей вакцины.

Если бы эти вакцины были разработаны и доказана их эффективность, то сейчас было бы намного легче разработать вакцину против нынешнего коронавируса. В этом году прозвенел третий звонок от коронавирусов за последние 20 лет.

Может, не будем ждать четвертого и разработаем вакцины? В 1950–1970-е годы прошлого века наша страна была лидером не только в космосе, но и в разработках и применении вакцин!

Теперь насчет диагностикумов в России. Россия — пожалуй, единственная среди развитых стран, которая не выставила в интернет состава своего диагностического препарата, разработанного в центре «Вектор». И единственная страна, в которой нет больше никаких диагностикумов на эту инфекцию.

А они нужны, поскольку есть множество желающих за свои средства провериться на наличие возбудителя и, возможно, на перенесенную инфекцию. Заинтересованные в разработке и производстве таких тестов частные компании тоже есть.

Наверное, стоило бы государственным структурам их на это простимулировать, включив применение таких тестов в страховую медицину и использовав другие способы.

Ко всему прочему это помогло бы создать конкуренцию среди тестов и повысить уровень их достоверности до максимально возможного в этой ситуации. Ведущие коммерческие разработчики ПЦР-тест-систем России имеют такое же мнение.

ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами.

Наконец, про лечебные препараты. Сейчас в Китае клинические испытания проходят несколько десятков препаратов из разных стран. Пока четких данных об эффективности какого-либо из них не опубликовано. Слухи про «Арбидол» пока так и остались слухами.

Наибольшую надежду вызывают препараты — ингибиторы протеаз, которые вроде бы на культурах клеток не дают вирусу проникать в клетки, препятствуя его размножению. Здесь понятна логика действия препаратов, часть из которых уже показала свою эффективность против других вирусов: ВИЧ и герпес-вируса.

Но не все они пока зарегистрированы в России.

Что дальше

Вернее всего, с этой пандемией человечество справится. Должны справиться и мы в России. Но наша готовность к последующим аналогичным эпидемиям должна быть повышена, потому что они неизбежно будут.

А пока среди всех респираторных инфекций у нас есть вакцина только против гриппа.

И это XXI век! У нас нет вакцин против вирусов парагриппа, респираторно-синцитиального вируса, метапневмовирусов, других коронавирусов, которые в сумме вызывают более трети всех респираторных инфекционных заболеваний, то есть уж точно больше, чем вирус гриппа.

И люди от них умирают не единично. В том числе от того, что мы почему-то не видим в них угрозы, а видим угрозы там, где их и нет вовсе или они намного менее значимы. Может быть, потому, что вирусы маленькие? Но ущерб-то от них очень большой: это неспасенные тысячи жизней граждан России.

Штаммы новой коронавирусной инфекции SARS-CoV-2

Все описанные ниже препараты и их комбинации следует принимать только после консультации со специалистом и внимательно ознакомившись с инструкцией. Необходимо учитывать лекарственную совместимость и взаимодействие. Они не являются рекомендацией к самолечению COVID-19 и других заболеваний. Решение о лечении пациента дома или в стационаре принимает только лечащий врач!

Штаммы коронавируса SARS-CoV-2: причины появления, симптомы, диагностика и способы лечения.

Определение

Коронавирусы — это семейство вирусов – носителей цепи рибонуклеиновой кислоты (РНК), содержащей всю информацию для репликации (копирования). Это семейство включает 43 вида. Они получили свое название из-за наличия шиповидных отростков, напоминающих солнечную корону. Поражают млекопитающих (включая человека), птиц и земноводных. Новый штамм коронавируса, заразный для людей и стремительно распространившийся среди населения планеты, впервые появился в китайской провинции Хубэй в конце 2019 года. Его назвали SARS-CoV-2 (Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus-2), а заболевание, которое он вызывает, – COVID-19. Геном SARS-CoV-2 – это длинная последовательность РНК, состоящая примерно из 30 тысяч «знаков», идущих друг за другом в строгом порядке. Когда вирус реплицируется, или воспроизводит копии самого себя, этот порядок немного изменяется. Такие единичные изменения называют «мутациями». ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами. Большинство мутаций не дают вирусу никаких преимуществ. Но некоторые оказываются вредными, и тогда у него появляются новые возможности, например, способность распространяться быстрее. Вирусы с одной или несколькими новыми мутациями называются «вариантами» и обозначаются буквами греческого алфавита. Исходя из их распространенности среди населения и данных о биологических свойствах, выделяют варианты, вызывающие озабоченность врачей или интерес ученых. Варианты, вызывающие озабоченность, имеют последствия для здоровья населения обычно в связи с наличием одного или нескольких из следующих свойств:

  • более высокая заразность (контагиозность или трансмиссивность);
  • более тяжелое течение заболевания (патогенность);
  • труднее нейтрализуются антителами (в том числе антителами, возникшими в результате предыдущей инфекции или вакцинации, и терапевтическими моноклональными антителами);
  • труднее обнаруживаются диагностическими тестами, такими как ПЦР (полимеразная цепная реакция).
Читайте также:  Размеры вирусов. Происхождение вирусов. Строение вирусов.

На сегодняшний день к вариантам вируса SARS-CoV-2, которые вызывают озабоченность, отнесены Альфа, Бета, Гамма, Дельта и Омикрон. Варианты Эта, Лямбда и Мю относят к вариантам, вызывающим интерес ученых. Мы будем называть их штаммами, поскольку так более привычно.

ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами.Британский штамм (вариант) Альфа выявили в октябре 2020 года. Новый штамм распространялся в полтора раза быстрее оригинального SARS-CoV-2, обнаруженного в Ухани (заразность штамма Альфа выше примерно на 60%). Он был более опасен для жизни, и заболевшие чаще попадали на лечение в стационары. Уровень летальности штамма Альфа в среднем на 59% выше, чем у штамма из Уханя. На сегодняшний день случаев данного варианта заболевания уже не наблюдается.

Южноафриканский штамм (вариант) Бета обнаружен в мае 2020 года. Среди всех известных штаммов этот вариант коронавируса считается наименее заразным, впрочем, он все равно распространяется быстрее, чем уханьский. Его трансмиссивность оценивается в среднем в 25%.

Бета-штамм почти вдвое чаще приводит к госпитализации, чем исходный коронавирус, он более опасен для жизни, чем штаммы Альфа и Гамма. Отличается тем, что им гораздо чаще заражаются молодые и исходно здоровые люди.

Этот штамм совершил большой эволюционный скачок и прошел около 50 мутаций, 30 из которых коснулись так называемого «спайк-белка» – шипов на оболочке вируса, с помощью которых он проникает в клетки человеческого организма.

Другая часть вируса, которая вступает в контакт с организмом, мутировала уже после попадания в клетку 10 раз, что ослабляет действие всех имеющихся вакцин, направленное на нейтрализацию шипов.

Бразильский штамм (вариант) Гамма обнаружен в ноябре 2020 года. Он считается более заразным, чем варианты Альфа и Бета. Его трансмиссивность оценивается в среднем в 38%.

Штамм Гамма примерно на 30% чаще приводит к госпитализации, чем оригинальный SARS-CoV-2. Он выделяется среди других штаммов повышенным риском повторного заболевания.

Кроме того, Гамма-штамм приводит к смертельному исходу в среднем на 50% чаще, чем исходный коронавирус.

Индийский штамм (вариант) Дельта выделен в октябре 2020 года. Штамм Дельта считается на 97% заразнее оригинального SARS-CoV-2 и на 60% — варианта Альфа.

Каждый носитель инфекции способен заразить 5–6 человек, инкубационный период сократился в среднем до пяти дней. В случае с Дельтой самым уязвимым возрастом принято считать 14–29 лет (это может быть объяснено тем, что молодежь социально более активна).

По состоянию на 14 декабря 2021 года на штамм Дельта приходилось около 70% всех заражений.

Из известных штаммов именно этот вариант Дельта приводит к наибольшему числу госпитализаций. Шанс попасть в больницу, заразившись этим штаммом SARS-CoV-2, выше на 85% по сравнению с Альфой. Летальность Дельты достигает 137%, если сравнивать с уханьским вирусом, и 85% – с Альфа-штаммом. За все время своего существования вариант Дельта не приобрел значимых мутаций и не претерпел никаких изменений. Штамм Омикрон был впервые обнаружен в Южно-Африканской Республике и Ботсване в ноябре 2021 года. Омикрон в несколько раз заразнее всех предыдущих штаммов, однако смертность от него пропорционально ниже. При этом именно Омикрон стал доминировать в России. Его выявляют у 70% вновь заболевших. Омикрон содержит в себе практически все мутации, которые делали его предшественников более заразными. Он обладает некоторым потенциалом ухода от иммунного ответа, от всех известных антител, вакцин и моноклональных антител. Каждая мутация, в результате которой одна аминокислота меняется на другую, выпадает или, наоборот, добавляется, приводит к изменениям той или иной части белка, в котором происходят эти изменения. Измененная часть может стать невидимой для антител, выработанных у вакцинированных или у тех, кто переболел другими штаммами коронавируса. Антитела очень точно узнают «свои» поверхности спайка и прикрепляются к ним. Смена формы белка может привести к тому, что антитела не заметят «врага» и не смогут выполнить защитные функции. Именно с этим связано одно из главных опасений экспертов – значительная часть антител, эффективных против существующих штаммов, могут оказаться бесполезными против Омикрона. Омикрон стал причиной новой волны заболеваемости даже среди тех, кто уже переболел коронавирусом ранее. Сопоставление «прогремевших» на весь мир штаммов коронавируса позволяет заподозрить следующие тенденции: заразность растет в геометрической прогрессии, развивается болезнь все стремительнее, однако не до конца ясно, что происходит с тяжестью течения инфекции. Не исключено, что она продолжит снижаться. Вирусу, чтобы эффективно размножаться, убивать хозяина не нужно. Хорошо приспособленный к человеческому организму вирус учится уходить от иммунного ответа, но при этом начинает хуже поражать рецепторы клеток. Вирусы часто эволюционируют в сторону смягчения течения заболевания и становятся более живучими и заразными, но менее летальными. Вероятность появления новых штаммов коронавируса существует. Но некоторые исследователи считают, что если Омикрон будет быстрее распространяться и легче переноситься, то эпидемия должна закончиться в ближайшем будущем. Это не говорит о том, что Омикрон совершенно безопасен, поскольку определенный процент летальности у него все-таки есть. Существует еще одна точка зрения относительно появления штамма Омикрон, основанная на том, что этот штамм не произошел от Дельты, а появился из совершенно другой части генеалогического дерева вируса. Ученые, которые ее придерживаются, считают, что, когда возникают два столь различающихся между собой штамма вируса, как Омикрон и Дельта, то уже не идет речь о вытеснении одного штамма другим. Вместо этого два подвида учатся сосуществовать в одном хозяине. При этом против Омикрона слабее действует Дельта-иммунитет, а против Дельты слабее работает иммунная система, встречавшаяся с Омикроном. Пока эта точка зрения не имеет строго научного обоснования, а существует в виде гипотезы. Но если она окажется верна, то даже при повсеместном распространении штамма Омикрон штамм Дельта никуда не исчезнет. То есть могут образоваться волны в противофазе: Дельта, потом Омикрон, потом снова Дельта, и так далее.

Симптомы новой коронавирусной инфекции, вызванной различными штаммами

Известно, что коронавирусы способны вызывать целый ряд заболеваний, которые проявляются респираторными симптомами обычной простуды, признаками тяжелого острого респираторного синдрома или смертельно опасной атипичной пневмонией. Мутации вируса влияют на течение инфекционного процесса. Штаммам коронавируса Альфа, Бэта и Гамма присущи такие симптомы, как высокая температура, изнурительный кашель, изменения во вкусовой чувствительности, потеря обоняния. У индийского штамма Дельта есть собственные отличительные характеристики. Инкубационный период сократился, а срок выведения вируса из организма, напротив, увеличился до 13–15 дней, что затрудняет определение факта выздоровления. Штамм часто вызывает проблемы с желудком и кишечником, боль в животе, рвоту, тошноту, обильные выделения из носа и прочее. При этом у заболевших крайне редко нарушается обоняние и бывает кашель.

Омикрон-штамм не проникает в легкие и остается в верхних дыхательных путях. По этой причине он проявляется болью в горле, осиплостью голоса, сухим кашлем, заложенностью носа, насморком, высокой температурой, ощущением тяжести в грудной клетке, одышкой, признаками конъюнктивита и повышением пульса. Сатурация (насыщение тканей кислородом) наблюдается на уровне 95%.

В среднем у 50% пациентов, инфицированных Омикроном, заболевание протекает бессимптомно. А еще у 40% — в легкой форме ОРВИ. В отличие от симптомов, вызываемых Дельта-штаммом, при заражении Омикроном больных сильнее беспокоят пульсирующая головная боль, слабость и миалгия (боль в мышцах), у детей могут появиться высыпания на коже. Заметим, что именно Омикрон-штамм оказался самым заразным для детей. У маленьких пациентов наблюдаются симптомы крупа, бронхиальной обструкции, а также бронхиолиты (поражение мелких бронхиол, сопровождающиеся дыхательной недостаточностью).

Диагностика новой коронавирусной инфекции, вызванной различными штаммами

С января 2022 года в России стали циркулировать два преобладающих штамма: Дельта и Омикрон. При осложненном течении заболевания возникает необходимость определения штамма с целью выбора оптимальной стратегии лечения. В Роспотребнадзоре сообщили, что на 1 марта 2022 года 97% всех подтвержденных случаев СOVID-19 протекают как ОРВИ или без симптомов Экспресс-тест, ПЦР, РНК вируса SARS-CoV-2, мазок. Определение РНК вируса SARS-CoV-2 (все виды известных штаммов, включая Delta и Omicron). ПЦР-тест на РНК коронавируса SARS-CoV-2, включая определение штаммов Омикрон и Дельта, в мазке со слизистой носоглотки и ротоглотки. ПЦР-тест на коронавирус SARS-CoV-2 (все виды известных штаммов, включая Delta и Omicron). Срочный, сверхчувствительный тест позволяет выявить наличие РНК коронавируса SARS-CoV-2 в мазке со слизистой носа, носоглотки и ротоглотки, но не определяет конкретный штамм. Лечение новой коронавирусной инфекции, вызванной различными штаммами

Читайте также:  Вода. Роль воды в мире. Биологическое значение воды.

Все основные принципы лечения заболевания домашних условиях сводятся к общей схеме, которая изложена в отдельной статье.

Осложнения

Все штаммы COVID-19 могут приводить к развитию тяжелых форм заболевания или смерти, в особенности это касается наиболее уязвимых групп населения. У пациентов с критическим течением заболевания развивается эндотелиальная дисфункция, коагулопатия, тромбозы с наличием антител к фосфолипидам, с клинической картиной, напоминающей катастрофический антифосфолипидный синдром.

Клинические и патологические изменения трудно дифференцировать с полиорганным тромбозом, развивающимся при ДВС-синдроме (синдроме диссеминированного внутрисосудистого свертывания) и тромботической микроангиопатии.

Цитокиновый шторм при COVID-19, как правило, приводит к развитию острого респираторного дистресс-синдрома, полиорганной недостаточности и может быть причиной летального исхода.

После перенесенного Дельта-штамма коронавируса у женщин в 1,5-2 раза чаще, чем у мужчин стали наблюдаться абдоминальные симптомы: боли и спазмы в животе, тошнота, снижение аппетита, нарушения стула. Снижение фертильности отмечается как у женщин, так и у мужчин. Поскольку Дельта-штаммом чаще, чем всеми предыдущими, заражаются молодые, мы можем наблюдать следующие редкие, но серьезные осложнения:

  • постковидный синдром, который поражает центральную нервную систему и влияет на факторы иммунитета;
  • мультисистемный воспалительный синдром у детей, который может вызвать воспаление жизненно важных органов, имея сходство с болезнью Кавасаки;
  • повреждение микроскопических нервных волокон роговицы, прозрачного слоя перед зрачком.

Легкая форма течения коронавирусной инфекции, к которой чаще всего приводит Омикрон, способна вызвать достаточно серьезные изменения внутренней оболочки сосудов, проявляясь тромбозом сетчатки глаза. Часто пациенты жалуются на боль в глазах, расплывчатое изображение предметов, пятна перед глазами. Могут развиться такие симптомы, как внезапная боль в руках или ногах, судороги мышц (чаще ног), отеки нижних конечностей, патологическое расширение вен мелкого калибра. Свидетельством тромбоэмболии легочной артерии может стать кашель, неожиданно появившийся после выздоровления.

Профилактика новой коронавирусной инфекции, вызванной различными штаммами

Эволюция вирусов — это обычная вещь. С помощью вакцин человечество справилось со многими из них: была сведена к минимуму заболеваемость оспой, корью, паротитом, полиомиелитом и краснухой.

Вакцины действуют и на уровне антител, и на уровне Т-клеточного ответа. Антитела, если их достаточное количество, начинают работать еще до того, как вирус начал размножаться, то есть в момент его попадания в организм. Речь идет в первую очередь об мРНК- и векторных вакцинах.

Если эффективность вакцин против уханьского штамма достигала 95%, то в отношении варианта Дельта она снизилась, хотя сохраняется на уровне 90% (данные для вакцины «Спутник V»), что несколько выше, чем результаты, продемонстрированные зарубежными вакцинами BioNTech/Pfizer и Moderna (около 88%, согласно исследованиям, опубликованным в научном журнале Lancet). Еще ниже эффективность у AstraZeneca — 60%. По данным ВОЗ, ряд исследований указывают на значительное снижение эффективности действия вакцины против штамма Омикрон по сравнению с Дельта-вариантом после двух доз вакцин Pfizer либо AstraZeneca. Спустя две недели после бустерной дозы вакцины эффективность действия препаратов против нового штамма повышается. Ученые из ведущего итальянского института инфекционных заболеваний сравнили эффективность разных препаратов против Омикрон-штамма. «Спутник V» в два с лишним раза превосходит вакцину Pfizer. Анализ показал, что 74,2% сывороток крови у вакцинированных «Спутником V» и 56,9% сывороток крови у вакцинированных Pfizer содержали антитела к варианту Омикрон. Хорошие результаты демонстрирует ревакцинация «Спутником Лайт», причем в сочетании и с отечественными препаратами, и с зарубежными.

Источники:

  1. Временные методические рекомендации. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (СOVID-19). Версия 15 (22.02.2022), Министерство здравоохранения Российской Федерации. Утверждены заместителем министра Здравоохранения Российской Федерации А.Н. Плутницким. – 245 с.
  2. Lucy G Thorne et al. Evolution of enhanced innate immune evasion by the SARS-CoV-2 B.1.1.7 UK variant/ bioRxiv 2021.06.06.446826v1; 
  3. Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, Jinnai Y, Konings F, Batra N, et al. (June 2021). “Increased transmissibility and global spread of SARS-CoV-2 variants of concern as at June 2021”. Euro Surveillance. 26 (24): 2100509.
  4. Finlay Campbell, Brett Archer, Henry Laurenson-Schafer, Yuka Jinnai, Franck Konings. Increased transmissibility and global spread of SARS-CoV-2 variants of concern as at June 2021 // Eurosurveillance. — 2021-06-17.
  5. David N. Fisman, Ashleigh R. Tuite. Progressive Increase in Virulence of Novel SARS-CoV-2 Variants in Ontario// medRxiv. — 2021-08-04.
  6. Lamiaa El-Shennawy et al. Circulating ACE2-expressing extracellular vesicles block broad strains of SARS-CoV-2// Nature communications (2022) 13:405. 

Все описанные ниже препараты и их комбинации следует принимать только после консультации со специалистом и внимательно ознакомившись с инструкцией. Необходимо учитывать лекарственную совместимость и взаимодействие. Они не являются рекомендацией к самолечению COVID-19 и других заболеваний. Решение о лечении пациента дома или в стационаре принимает только лечащий врач!

ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами

ДИЧ образуются при серийном пассировании в культурах клеток или эмбрионах птиц. При высокой множественности заражения их концентрация возрастает.

Это обусловлено несколькими механизмами: 1) их укороченный геном размножается быстрее; 2) они менее часто уклоняются от функционирования в качестве матриц транскрипции мРНК и 3) они обладают повышенным афинитетом для вирусной репликазы, дающим им преимущество перед их полно-геномными аналогами.

Этим также объясняется то, почему ДИЧ интерферируют с репликацией инфекционных вирионов с полноразмерным РНК геномом, прогрессивно повышая эффективность в серийных пассажах.

Морфологически ДИЧ подобны родительским вирионам и содержат все структурные белки в той же пропорции, что и стандартный вирус.

Однако у вируса верикулярного стоматита ДИЧ короче (пулевидные частицы), образуются путем множественных делеций генома и содержат от 60 до 25% вирусного генома.

Они интерферируют только с гомотипичными штаммами вируса. Образование дефектных частиц может зависеть от вакцинного штамма вируса.

Заражение культуры клеток вакцинным штаммом Эдмонстон-Шварц и Эдмонстон-Эндерс вируса кори при небольшой множественности заражения не индуцировали образования субгеномной РНК.

Генерация некоторых дефектных ДНК вирусных геномов может сопровождаться значительными модификациями ДНК. Например, ДИЧ парвовируса обычно содержат копии оригинальной геномной ДНК, хотя иногда с примесью ДНК клеточного происхождения.

ДИЧ могут снижать вирулентность стандартного вируса. Разведенный вирус может оказаться вирулентным, а концентрированный — не вирулентным. Роль ДИЧ при различных инфекциях все еще выясняется.

ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами.

В последние годы секвенирование генома вирусов привело к пониманию механизма аттенуации и позволило повысить эффективность и безопасность живых вакцин. У большинства вирусов за вирулентность и тропизм ответственны несколько генов, которые действуют различными путями.

Например, в отличие от системной инфекции, вызванной вирулентным полевым вирусом, некоторые вакцинные вирусы, обладающие тропизмом к респираторному тракту, размножаются только в верхних дыхательных путях; в других случаях, вакцинный вирус, введенный орально, размножается только в специфических эпителиальных клетках кишечника.

Аттенуированный штамм 17-D вируса желтой лихорадки обладает пониженным тропизмом к печени обезьян и это является признаком, с помощью которого мутант может быть признан аттенуированным для человека.

Это подтверждалось при дальнейших исследованиях в клинических условиях.

Подобным образом штаммы полиовируса, аттенуированные естественным путем или пассированием в культуре клеток, утратили нейровирулентность.

Аттенуация вируса серийными пассажами в неестественном хозяине

Большинство живых вирусных вакцин, применяемых сегодня, получены эмпирически серийными пассажами в гетерологичном организме или культуре клеток естественного или гетерологичного хозяина. Адаптация вируса к более интенсивному размножению в необычных условиях сопровождается прогрессирующим снижением и потерей вирулентности для естественного хозяина.

Серийные пассажи в гетерологичном хозяине были классическим способом эмпирической аттенуации вируса.

Например, вирусы чумы крупного рогатого скота и классической чумы свиней были аттенуированы и использованы в качестве соответствующих живых вакцин после длительного серийного пассирования в организме кролика.

Значительно раньше таким способом получен аттенуированный вирус бешенства. Аттенуированные штаммы многих вирусов получены серийным пассированием в эмбрионах птиц.

В процессе многочисленных пассажей в неестественном хозяине или культуре клеток исходный вирулентный штамм вируса может накопить множество точечных мутаций в геноме, которые лежат в основе аттенуации. Однако, несмотря на многие весьма ценные практические результаты, аттенуация вирусов путем пассирования в системе неестественного хозяина — в целом процесс неуправляемый, а результаты его непредсказуемы.

Получение удовлетворительных аттенуированных мутантов является результатом «генетической рулетки» вследствие случайной селекции мутантов с желаемой степенью аттенуации и выраженной иммуногенностью.

Читайте также:  Изакардин - инструкция по применению, аналоги, отзывы и формы выпуска (спрей подъязычный 1,25 мг в 1 дозе, уколы в ампулах для инъекций 1 мг концентрат) лекарства для лечения ибс, стенокардии и инфаркта у взрослых, детей и при беременности

Это положение, в частности, подтверждается неудачными результатами повторного получения вакцинного штамма 17Д вируса желтой лихорадки.

Генетическая основа аттенуации вакцинных вирусов кори, паротита, краснухи, желтой лихорадки, ротавируса и осповакцины не известна, тогда как генетические детерминанты аттенуации двух из трех вакцинных штаммов полиовируса достаточно изучены.

Живые вакцины против чумы КРС (ЧКРС) являются одними из наиболее безопасных и эффективных вирусных вакцин. Вирус ЧКРС аттенуирован разными способами и практически с одинаковым результатом.

Три типа аттенуированных вакцин использовали десятилетиями для ликвидации ЧКРС: лапинизированную, капринизированную и культуральную. Капринизированная вакцина была первой живой вакциной против ЧКРС и использовалась до недавнего времени в Индии.

Лапинизированный штамм (Накамура-Ш) адаптировали к культуре клеток почки телят или куриным эмбрионам. Лапинизирован-но-авинизированную (LA) вакцину в основном применяли в Азии.

В странах стационарно неблагополучных по ЧКРС в основном применяли культуральную вакцину RBOK из штамма Kabete «О», который не передается при контакте и создает напряженный иммунитет длительностью не менее 10 лет. Культуральные вакцины из других штаммов, в том числе созданных в СССР, обладали аналогичными свойствами.

Несмотря на достигнутые успехи в получении аттенуированных вирусных вакцин эмпирическим путем, на современном этапе происходит замена «генетической рулетки» рациональным констуированием генно-инженерных вакцин. В последнем случае, мутации, связанные с аттенуацией, известны, стабильны и предсказуемы.

Аттенуация вирусов посредством длительного пассирования в клеточных культурах в настоящее время является основным методом получения живых вирусных вакцин. Этот метод основан на селекции пассажных мутантов, отличающихся биологическими свойствами от исходных вирулентных штаммов.

Полученные таким образом аттенуированные иммуногенные штаммы аккумулируют в себе множество спонтанных мутаций, что гарантирует им генетическую и фенотипическую стабильность, хотя генетическая основа аттенуации используемых живых вирусных вакцин в большинстве случаев остается невыясненной.

Идентификация вирусных генов, определяющих вирулентность, представляет огромный интерес для получения авирулентных вакцинных штаммов, а также их использования в качестве носителей чужеродных генов.

Поэтому изучению молекулярных основ аттенуации вирусов уделяется большое внимание.

Наиболее часто с этой целью сопоставляют первичную структуру геномов вирулентных и аттенуированных штаммов и реже прибегают к изучению влияния инактивации или делетирования различных генов на вирулентные свойства вирусов.

— Также рекомендуем «Учение об аттенуации Сэбина. Аттенуация вируса полиомиелита по Сэбину.»

Оглавление темы «Физические методы инактивации вирусов для вакцин.»: 1. Физические методы инактивации вирусов. Гамма-лучи в инактивации вирусов. 2. Оценка полноты инактивации вирионов. Вакцина против полиомиелита — ящура. 3. Проблемы инактивации вирусов. Пути разрешения проблем при физической инактивации вирусов. 4. Живые вирусные вакцины. Особенности живых вакцин. 5. Аттенуация вирусов. Генетические мутации вирусов. 6. Делеционные мутации вирусов. Вставки или инсерции в геном вируса. 7. ДИЧ-мутации вирусов. Аттенуация вируса серийными пассажами. 8. Учение об аттенуации Сэбина. Аттенуация вируса полиомиелита по Сэбину. 9. Живая аттенуированная вакцина против кори. Аттенуированный вирус паротита, ветряной оспы, краснухи. 10. Аттенуация вируса гриппа. Свойства аттенуированного вируса гриппа.

2.Живые вакцины, методы аттенуации вакцинных штаммов и особенности их применения

Живые
вакцины
— препараты, действующим началом в
которых являются ослабленные тем или
иным способом, потерявшие свою
вирулентность, но сохранившие специфическую
антигенность штаммы патогенных бактерий.
Примером таких вакцин являются БЦЖ и
вакцина против натуральной оспы человека,
в качестве которой используется
непатогенный для человека вирус оспы
коров.

Живые
вакцины — препараты, действующим началом
в которых являются ослабленные тем или
иным способом, потерявшие свою
вирулентность, но сохранившие специфическую
антигенность штаммы патогенных бактерий.

Аттенуация
(ослабление) возможна путём воздействия
на штамм химических (мутагены) и физических
(температура) факторов или посредством
длительных пассажей через невосприимчивый
организм.

Так же в качестве живых вакцин
используются дивергентные штаммы
(непатогенные для человека), имеющие
общие протективные антигены с патогенными
для человека микробами.

Примером такой
вакцины является БЦЖ и вакцина против
натуральной оспы.

Возможно
получение живых вакцин генно-инженерным
способом. Принцип получения таких вакцин
сводится к созданию непатогенных для
человека рекмбинантных штаммов, несущих
протективные антигены патогенных
микробов и способных при введении в
орг. человека размножаться и создавать
иммунитет. Такие вакцины называют
векторными.

Вне
зависимости от того, какие штаммы
включены в вакцины, бактерии получают
путём выращивания на искусственных
питательных средах, культурах клеток
или куриных эмбрионах. В живую вакцину,
как правило, добавляют стабилизатор,
после чего подвергают лиофильному
высушиванию.

В
связи с тем, что живые вакцины способны
вызывать вакцинную инфекцию (живые
аттенуированные микробы размножаются
в организме, вызывая воспалительный
процесс проходящий без клинических
проявлений), они всегда вызывают
перестройку иммунобиологического
статуса организма и образование
специфических антител. Это так же может
являться недостатком, т. к. живые вакцины
чаще вызывают аллергические реакции.

Вакцины
данного типа, как правило, вводятся
однократно.

Примеры:
сибиреязвенная вакцина, чумная вакцина,
бруцеллёзная вакцина, БЦЖ вакцина,
оспенная дермальная вакцина.

3.
У
новорожденного обнаружен конъюнктивит
с гнойным отделяемым. Мать практически
здорова, но в ее анамнезе – воспаление
придатков матки. Что можно заподозрить,
и как установить этиологию заболевания
у ребенка и матери
?

Диагностика:
бактериоскопический метод, в мазках,
окрашенных по Граму должен быть грам –
диплококки бобовидной формы, в мазке,
окрашенном метиленовым синим картина
незавершенного фагоцитоза. Если в мазке
много грам- бактерий, то применяют РИФ.

Экзаменационный билет № 42

1. Паповавирусы. Папилломавирусы человека

Паповавирусы
(папилломавирусы, полиомавирусы и
вакуолизирующий обезьяний вирус, SV-40)
– семейство Papovaviridae безоболочечных
ДНК-содержащих вирусов; включает 2 рода: 
Papillomaviridae и Polyomaviridae.

Вирион
папилломавируса без  оболочки.
Различают более 120 генотипов
папилломавирусов.  С 1 января 2002 года
вирус папилломы человека в соответствии
с решениями 7-го Международного Конгресса
по таксономии вирусов выделен в новое
семейство – Papillomaviridae

Папилломавирусная
инфекция

– это хроническое инфекционное
заболевание, возбудителем которого
является вирус папилломы  человека.

 
Вирус
папилломы человека (ВПЧ) представлен
остроконечными кондиломами, вирусными
бородавками, венерическим кондиломатозом.

Это — группа вирусных заболеваний,
которым свойственно развиваться в
качестве инородных образований на коже,
а также на слизистых оболочках, вызывая
в них хроническое воспаление и образование
папиллом

Эпидемиология.Папилломавирусы
являются антропонозными возбудителями.

Основным путем заражения аногенитальными
бородавками (остроконечными кондиломами)
является половой путь заражения (включая
орально-генитальные контакты и анальный
секс), поэтому  данную инфекцию относят
к группе заболеваний, передающихся
половым  путем (ЗППП).

Есть вероятность
сохранения вирусов в течение определенного
времени в отшелушивающихся клетках
кожи, поэтому для некоторых заболеваний,
вызываемых вирусом, вероятен
контактно-бытовой путь заражения
(бородавки) при условии микроповреждений
кожи Пик заболеваемости приходится на
период вскоре после начала половой
жизни. Вероятность заражения при половом
контакте составляет 60–67%. Возможно
заражение папилломавирусом новорожденных
при родах, что является причиной
возникновения ларингеального папилломатоза
у детей и аногенитальных бородавок у
младенцев.

Клиника.Инкубационный
период заболевания может длиться от
одного до пяти месяцев. Чаще всего
папиллома вирус существует в крови
носителя бессимптомно, если иммунная
защита организма достаточна для того,
чтобы не допускать его излишней
активизации. Симптомы вируса папилломы
появляются только тогда, когда у больного
наблюдается снижение  иммунитета. 

У
мужчин появление остроконечных кондилом
чаще всего наблюдается на борозде
полового члена и уздечке, что затрудняет
мочеиспускательный процесс. Как правило,
прощупать ее несложно. У женщин появляются
папилломы на наружных половых органах
в области малых половых губ, на шейке
матки, также может развиваться рак шейки
матки. Очень редко встречаются
остроконечные бородавки в ротовой
полости

ВПЧ
является довольно распространенным
вирусом, и риск заражения им выше у
следующих групп лиц:

 —
лица, рано начавшие половую жизнь 
 —
лица, имеющие нескольких половых
партнеров
 —
наличие сопутствующих заболеваний,
передающихся половым путем (хламидиоз,
микоплазмоз, трихомониаз, гонорея и
др.

)
 —
лица с ослабленным иммунитетом (после
тяжелой болезни, ВИЧ-инфицированные,
больные сахарным диабетом, лица,
принимающие лекарства, которые подавляют
иммунитет и т.д.

)
 —
женщины, которые делали аборты и др.

Микробиологическая
диагностика.

Вирусы содержатся в кератинизированных
клетках папиллом, однако не культивируются.
Антитела образуются в низком титре. Для
диагностики применим метод гибридизации
ДНК.

Лечение.
Этиотропная
терапия данного заболевания не
разработана. Лечение направлено на
удаление экзофитных папиллом с применением
хирургических и деструктивных методов.
Возможно саморазрушение генитальных
кондилом.

Профилактика.Для
профилактики ВПЧ в настоящее время
созданы соответствующие вакцинные
VLP-препараты и для ВПЧ, направленных на
профилактику заражения против ВПЧ 6,
11, 16 и 18-го типов.

При создании противовирусных
вакцин используется подход, основанный
на использовании в качестве вакцинных
препаратов, так называемых вирусоподобных
частиц (VLP). Иммунизация такими препаратами
сопровождается образованием
типоспецифических нейтрализующих
антител.

ВОЗ приступила к широкой
программе клинических испытаний и
использованию этих препаратов в практике.

Ссылка на основную публикацию
Adblock
detector